Wim Ludeke is lid van het College van Bestuur van de PO-Raad. Dat is de koepelorganisatie voor besturen van het primair onderwijs. Hij vertegenwoordigt daarin het speciaal onderwijs. Hij is eveneens voorzitter van het College van Bestuur bij Stichting De Onderwijsspecialisten. Tot 2016 was hij bestuurslid van sportkoepel NOC*NSF met als aandachtsgebied gehandicaptensport.